2013 no empezó de la mejor manera posible para Juan Carlos, lesionado desde principio de año hasta mediados de Febrero. Tras una gran primera temporada en el Real Zaragoza en Primera División, donde había logrado tres tantos y resultado decisivo para la permanencia del equipo, en verano de 2012 llegó cedido procedente del Sporting de Braga al Betis, completando un ataque demoledor con jugadores de la talla de Joel Campbell, Vadillo o Dorlán Pabón y logrando la clasificación para la Europa League.

1er Semestre: Precisión Suiza

Tras recuperarse de la lesión inicial, durante el tramo final de la campaña "el galgo", como también es conocido, demostró no solo la rapidez y verticalidad de las que ya se sabía poseedor, sino además una gran habilidad y precisión en el último pase, lo que contribuyó a que completase la temporada con cuatro asistencias y un gol. La marcha de Jonathan Pereira en el mercado invernal propició que Juan Carlos ganase peso en el equipo, completando un total de 25 partidos con la elástica verdiblanca. A pesar de los buenos datos como asistente de Juan Carlos, lo cierto es que no hizo alarde de su capacidad goleadora, en un Betis diseñado para jugar al contragolpe y en el que los goles llegaban de las botas de Rubén Castro y Jorge Molina.

En verano, con la cesión de Campbell torciéndose cada vez más según avanzaban las conversaciones, la opción de Juan Carlos ganó enteros en las oficinas de Heliópolis. Tras duras negociaciones, se cerró el acuerdo por el que Juan Carlos continuaba en la disciplina verdiblanca, en una operación a dos bandas en la que Agra se marchaba a su vez cedido al Sporting de Braga durante dos campañas. El club decidió apostar de nuevo por un jugador en evidente progresión.

2º Semestre: remando a contracorriente

Siguiendo en la misma linea del resto de sus compañeros, el final de 2013 ha estado lleno de luces y sombras para Juan Carlos: en anteriores campañas a estas alturas no había jugado tantos partidos en Liga, si bien es cierto que esta temporada la mayoría de las veces ha partido desde el banquillo. Con la llegada de Juanfran procedente del Castilla y la constante progresión de Vadillo, las bandas tenían un dueño claro. Sin embargo, esto no ha sido impedimento para que Juan Carlos haya debutado en la Europa League, donde ha disputado dos partidos, contribuyendo a una victoria y un empate. A pesar de la escasa participación del madrileño durante el primer tramo de la temporada, ha participado en un total de doce partidos, logrando dos asistencias.

Con Garrido a los mandos del equipo, Juan Carlos ha ido ganando protagonismo, partiendo desde el inicio en partidos importantes como el del Almería en la última jornada del año que se saldó con derrota. En el seno del club se espera más del madrileño, creen que la reacción debe llegar a través de jugadores como él, cuya progresión está en constante crecimiento. Veremos si 2014 es el año de Juan Carlos...