El sorteo de los dieciseisavos de final de la Copa del Rey ha deparado que el rival del Rayo Vallecano para la presente edición sea el Real Valladolid de Juan Ignacio Martínez. La ida de esta eliminatoria se jugará entre el 6 y 8 de diciembre en feudo pucelano y la vuelta está prevista sobre el 18 de diciembre, en territorio franjirrojo.
En el supuesto caso de que los de Jémez superaran la eliminatoria frente al conjunto vallisoletano, se enfrentarían en octavos de final al vencedor del Recreativo-Levante. Dicho encuentro se disputará entre el 8-15 de enero, a principios de 2014. En caso de que el conjunto rayista continuase avanzando en el torneo del K.O, se enfrentaría al ganador del Cartagena - FC Barcelona | Girona - Getafe en cuartos de final (22-29 de enero).
Ya en semifinales, el ganador del Algeciras - Real Sociedad / Villarreal - Elche contra el vencedor de Las Palmas - Almería / Racing - Sevilla, se cruzaría contra el Rayo Vallecano, en caso de que los de Jémez continuass en la competición para enfrentarse en semifinales (5-12 febrero). La final del torneo ha sido fijada para el 18 de abril aunque todavía se desconozca el Estadio que la albergará.
Emparejamientos de Copa del Rey 2013/3014
