Si riparte dalla terza sessione di libere, decisiva per stabilire i primi dieci piloti che passeranno direttamente al secondo turno di qualifiche. Il sole splende anche oggi sul circuito di Motegi, quindi i piloti possono lavorare in tranquillità. È il campione del mondo in carica Marc Márquez a stampare il miglior tempo sia del turno che della classifica combinata, passando direttamente in Q2 assieme ad Andrea Dovizioso, Valentino Rossi, Pol Espargaró, Jorge Lorenzo, Andrea Iannone, Bradley Smith, Cal Crutchlow, Dani Pedrosa e Stefan Bradl, mentre tutti gli altri piloti dovranno disputare la Q1.

Comincia l’azione in questa seconda giornata con tutti i piloti in pista pronti a migliorarsi per rientrare in top 10. Attualmente la classifica, basandosi sui tempi del primo giorno, vede Dovizioso, Lorenzo, Bradl, Pedrosa, Rossi, Márquez, Pol Espargaró, Smith, Iannone e Hernandez direttamente in Q2, ma ora vedremo se la classifica si manterrà più o meno così o se ci saranno importanti cambiamenti. Da registrare nei primi minuti la caduta di Aoyama, mentre c’è qualche problema tecnico per Márquez, con la sua Honda che si ferma ed il giovane pilota costretto a spingerla fuori dalla pista ed a tornare a piedi al box. Dopo dieci minuti l’unica differenza è la posizione di Pol Espargaró, che ha migliorato il proprio tempo piazzandosi in quarta posizione nella classifica combinata, mentre Márquez riesce a tornare in pista sulla seconda moto stampando il secondo miglior tempo assoluto. Ma il pilota di Cervera non si ferma, scendendo poco dopo sotto l’1:45 e marcando un 1:44.940 che lo porta in prima posizione in classifica combinata, abbassando anche di qualche centesimo il record stabilito da Jorge Lorenzo durante le qualifiche nel 2012. Crutchlow risale provvisoriamente in nona posizione, con Hernandez che quindi scivola in undicesima posizione, mentre Pol Espargaró, terzo ora, è protagonista di un dritto e di una leggera caduta senza conseguenze a pochi minuti dalla fine, cosa che non gli impedisce di rientrare subito in pista per concludere il turno. Migliora anche Smith, quinto ora davanti a Bradl, ma sono gli ultimi minuti quindi tutti i piloti sono in pista per cercare di abbassare i propri tempi. Alla fine è Márquez a chiudere il turno con il miglior tempo assoluto, davanti a Dovizioso, che non ha migliorato il proprio tempo rispetto a ieri, e Rossi, entrambi staccati di circa due decimi.

La classifica dei dieci piloti in Q2:

1. Marc MARQUEZ - Repsol Honda Team - 1:44.940

2. Andrea DOVIZIOSO - Ducati Team - +0.200

3. Valentino ROSSI - Movistar Yamaha MotoGP - +0.227

4. Pol ESPARGARO - Monster Yamaha Tech 3 - +0.299

5. Jorge LORENZO - Movistar Yamaha MotoGP - +0.423

6. Andrea IANNONE - Pramac Racing - +0.460

7. Bradley SMITH - Monster Yamaha Tech 3 - +0.537

8. Cal CRUTCHLOW - Ducati Team - +0.598

9. Dani PEDROSA - Repsol Honda Team - +0.608

10. Stefan BRADL - LCR Honda MotoGP - +0.697