A pocos días de que comience la Liga Águila 2016-I, la Dimayor realizó el sorteo para conocer los equipos que se enfrentarán en cada una de las fechas de este semestre.
Millonarios comenzará la Liga Águila debutando en condición de local enfrentandose Patriotas. Por otro lado, el equipo embajador cerrará la fase de todos contra todos en condición de visitante frente al Independiente Medellín.
Los clásicos se vivirán en la fecha dos y en la fecha diez.
A continuación se dará a conocer el calendario completo de Millonarios:
Águilas
| Fecha | Equipo 1 | Equipo 2 |
| Fecha 1 | Millonarios | Patriotas |
| Fecha 2 | Santa Fe | Millonarios |
| Fecha 3 | Millonarios | Pasto |
| Fecha 4 | Alianza Petrolera | |
| Fecha 5 | Millonarios | Jaguares |
| Fecha 6 | Millonarios | |
| Fecha 7 | Millonarios | Tolima |
| Fecha 8 | Fortaleza |
Millonarios |
| Fecha 9 | Millonarios | Nacional |
| Fecha 10 | Millonarios | Santa Fe |
| Fecha 11 | Once Caldas | Millonarios |
| Fecha 12 | Millonarios | Chicó |
| Fecha 13 | Cali | Millonarios |
| Fecha 14 | Bucaramanga | Millonarios |
| Fecha 15 | Millonarios | Junior |
| Fecha 16 | Envigado | Millonarios |
| Fecha 17 | Millonarios | Cortuluá |
| Fecha 18 | Equidad | Millonarios |
| Fecha 19 | Millonarios | Huila |
| Fecha 20 | Medellín | Millonarios |