Nacido en el Puerto de Santamaría en 1981 y formado en las categorías inferiores del Betis, un joven Joaquín empezó a despuntar en el conjunto verdiblanco, lo que le permitió debutar con la Selección Española en 2002. Con el equipo bético consiguió hacerse con una Copa del Rey y disputar la Champions League. Su buen hacer hizo que, en el año 2006, el gaditano despertara el interés del Valencia y, a pesar de los intentos de Lopera de retenerle e incluso castigarle enviándolo cedido al Albacete, Joaquín firmó su contrato con el conjunto che por una cantidad cercana a los 25 millones de euros.
El fichaje de Joaquín, que llegó como una gran estrella, provocó la ilusión de la afición valencianista, que le recibió como tal, en una presentación multitudinaria a la que acudieron 18.500 personas a Mestalla. A pesar de que su primer año no fue bueno y le costó adaptarse, en su segunda campaña como che logró levantar la Copa del Rey, aunque en liga el equipo no logró carburar, pese a tener una de las mejores delanteras de la categoría, con Mata, Silva, Villa y el propio Joaquín.
Hasta la incursión de Pablo Hernández la temporada 2009-2010, nadie dudó de su titularidad en el conjunto blanquinegro. Sin embargo, a partir de esa campaña, ambos extremos compitieron por hacerse con la banda derecha valencianista. En verano de 2011, tras cinco temporadas en la capital del Turia, en las que disputó 218 partidos oficiales en los que anotó 30 goles, dio 31 asistencias y llegó a ser capitán, Joaquín se marchó. Sin embargo, se llevó consigo el cariño de la afición valencianista, el mismo que él ha profesado siempre hacia los seguidores ches.
El del Puerto de Santamaría puso rumbo a Andalucía y recaló en el Málaga por cuatro millones de euros. En el equipo boquerón coincidió con grandes jugadores como Cazorla, Van Nistelrooy, Monreal, Toulalan o Isco. Allí, Joaquín vivió una segunda juventud, que permitieron al conjunto dirigido por Manuel Pellegrini clasificarse para la fase previa de la Champions League, tras acabar la liga en cuarta posición. Tras competir de manera magnífica en la competición continental, el Málaga fue apeado de la Champions en cuartos de final frente al Borussia Dortmund. Fue el propio Joaquín quien inauguró el marcador en el Signal Iduna Park, pero dos goles en el descuento, uno de ellos en fuera de juego, impidieron que el Málaga consiguiera la gesta y avanzara en Europa. Tras un empate a cero en La Rosaleda, el partido definitivo acabó 3-2.
Tras dos grandes temporadas como blanquiazul, Joaquín dejó atrás la liga española y fichó por la Fiorentina, donde permaneció dos temporadas y consiguió llegar a semifinales de la Europa League. Finalmente, en 2015 el gaditano regresó a sus orígenes y fichó por el Betis, donde ha vuelto a ser el capitán del equipo de sus amores y se ha convertido en indiscutible para todos los técnicos.
Así, Joaquín se convirtió en un referente en ambos conjuntos, siendo un puñal por el costado derecho de Valencia y Málaga, mostrando por Europa la finta y el sprint que la caracterizaron. El gaditano ha dejado una huella imborrable de goles, asistencias y buen humor allá por donde ha pasado.
