El año 2006 se identifica como punto de partida a la que se reconoce como la etapa más convulsa del Tenerife a nivel institucional. Reiteradas acusaciones por corrupción sobrevolaron la isla canaria en estos últimos años. En el plano deportivo, tras varias temporadas de dinámicas irregulares en la Segunda División, lograron el ascenso a la máxima categoría del fútbol español en 2009 en la penúltima jornada con una escueta victoria frente al Girona.

El posterior año no fue sencillo. La gran deuda heredada por la nueva administración no permitió al equipo directivo apostar por un proyecto de garantías para afrontar esa nueva andadura del equipo por la Liga BBVA.  A final de temporada se consumó el descenso, quedando a tan solo un punto de la salvación, y comenzó la caída libre de un histórico de nuestro balompié.

El equipo comenzó con mal pie en su vuelta a la categoría de plata. Tras una irregular pretemporada, el Tenerife cayó eliminado en la primera ronda de la Copa del Rey, lo que motivó la destitución de Gonzalo Arconada y la llegada de David Amaral. Con el nuevo técnico se ganó en trabajo y compromiso, hubo una mayor apuesta por la cantera ante el bajo rendimiento de los jugadores más veteranos y se hizo amago de pelear por la salvación. La reacción no fue suficiente y el equipo perdió la categoría por segundo año consecutivo. Vuelta a la Segunda B.

En la categoría de bronce no se logró evitar la irregularidad de campañas anteriores. Hasta tres entrenadores dirigieron al equipo ese año, en el que se alcanzó la segunda posición. En los play-off, la Ponferradina acabó con la ilusión de la afición tinerfeña, la que se volcó con su equipo hasta el final en una especie de reencuentro harmonioso con el club.

El dos de junio de 2013 el equipo logra el ascenso tras superar en la eliminatoria a L’Hospitalet, con lo que se hizo efectivo el regreso del Tenerife al fútbol profesional, en donde se mantiene a día de hoy. La pasada campaña fue la que más cerca tuvo la promoción, pero cayó frente al Getafe en la última ronda de esta.

Historia de ascensos y descensos, de éxitos deportivos y de batacazos. Lo único que acompañó en todo momento al equipo fue la sensación de inestabilidad, una circunstancia que condicionó su rendimiento campaña tras campaña.