El jugador del Sporting fue convocado por el técnico de la selección croata, Ante Caçic, para jugar dos partidos con su selección, uno para la clasificación de la Copa Mundial de Fútbol, y otro amistoso.
En el primer partido, la selección de Duje Čop se enfrentaba al conjunto ucraniano. Los balcánicos consiguieron alzarse con la victoria (1-0), aunque el jugador del equipo gijonés no saltó al terreno de juego. En el siguiente encuentro los fieros se enfrentaban a la selección de Estonia en Le Coq Arena de Tallin. Duje Čop salió al campo siendo titular, aunque no sobresalió ni pudo evitar la dolorosa derrota de los suyos por 3-0. En este partido el entrenador de Croacia, Ante Caçic, realizó numeroso cambios en la plantilla con respecto al encuentro ante Ucrania que no funcionaron. Esta situación fue aprovechada por la selección de estonia cuyos jugadores, Siim Luts, Konstantin Vassilljev y Sergei Zenjov anotaron los tres tantos del partido dando la victoria a Estonia.
Duje Čop ya había sido convocado para representar a su nación hasta en nueve ocasiones. Además estuvo en la lista de jugadores preseleccionados para la Copa Mundial de Fútbol celebrada en Brasil en 2014, pero finalmente no participó en el torneo. Tuvo más suerte en 2016 cuando disputó la Eurocopa celebrada en Francia, en la que jugó el último partido de la fase de grupos contra la selección española. Los croatas ganaron este encuentro y dificultaron la situación de los españoles que caerían eliminados más tarde contra Italia. Los de los Balcanes corrieron la misma suerte cuando la selección portuguesa les anotó un gol que clasificaba a Portugal y eliminaba a Croacia. El jugador del Sporting marcó su primer gol con su selección el 15 de noviembre de 2016 durante un encuentro amistoso contra Irlanda del Norte, el cual ganaron los croatas 0-3.
El técnico del Sporting, Joan Francesc Ferrer Sicilia (Rubi), podrá contar con el jugador croata para la preparación del partido contra el Sevilla que tendrá lugar este domingo a las 12:00 horas en el Sánchez-Pizjuán.