La pioggia si è fatta vedere sul tracciato di Motegi, costringendo i piloti della categoria Moto2 ad una gara posticipata ed in condizioni diverse rispetto a quelle in cui hanno corso finora, anche se la pista comincia in alcuni tratti ad asciugarsi. Queste condizioni hanno comunque spinto la Direzione Gara a ridurre i giri, che quindi saranno solo 15 per la categoria intermedia. È il neo campione del mondo Johann Zarco a vincere questa gara, davanti a Jonas Folger e Sandro Cortese.

Allo spegnersi del semaforo c'è lo scatto dei ragazzi della prima fila, con Folger che prende la testa della corsa davanti a Zarco, Luthi, Nakagami, Lowes e Rins, pilota che ha perso qualche posizione alla partenza. Intanto viene segnalato un drive through per Louis Rossi, autore di una partenza anticipata, mentre dopo due giri finisce a terra Luthi, che riesce a ripartire ma è precipitato in fondo alla classifica. In testa intanto Folger e Zarco già preso un margine di ben più di quattro secondi sugli inseguitori, lasciando intendere che saranno loro a contendersi la vittoria, mentre dietro di loro è battaglia per il terzo gradino del podio tra Nakagami e Rins. Ci mette poco il campione del mondo a rompere gli indugi e si prende la prima posizione, mentre Nakagami è protagonista di una scivolata e Rins si trova in difficoltà, cosa che gli condiziona la gara perché a poco meno di dieci giri dalla fine è decimo. La terza posizione attuale è occupata da Shah, che riesce a prendere margine sui rivali Syahrin e Márquez, ma le condizioni della pista creano problemi anche al giovane rookie spagnolo, che a causa di una quasi-caduta ed una conseguente uscita di pista precipita in ventesima posizione. Finisce a terra Salom, che quindi chiude in anticipo la gara, mentre Cortese ha la meglio su Syahrin e recupera presto su Shah, attualmente sul terzo gradino del podio, ingaggiando un bel duello finché l'italo-tedesco non ha la meglio.

È Johann Zarco a porre un altro sigillo ad una stagione che l'ha meritatamente coronato campione del mondo, andando a vincere anche questa gara di Motegi. Sale sul secondo gradino del podio Jonas Folger, mentre conclude in terza posizione Sandro Cortese. Per gli italiani, Simone Corsi chiude in settima piazza, mentre Lorenzo Baldassarri è dodicesimo.

La classifica:

1 25 5 Johann ZARCO FRA Ajo Motorsport Kalex 138.0 31'17.900
2 20 94 Jonas FOLGER GER AGR Team Kalex 137.7 +4.505
3 16 11 Sandro CORTESE GER Dynavolt Intact GP Kalex 136.9 +15.433
4 13 25 Azlan SHAH MAL IDEMITSU Honda Team Asia Kalex 136.7 +17.348
5 11 55 Hafizh SYAHRIN MAL Petronas Raceline Malaysia Kalex 136.3 +22.858
6 10 88 Ricard CARDUS SPA JPMoto Malaysia Suter 136.2 +24.970
7 9 3 Simone CORSI ITA Forward Racing Kalex 136.1 +25.759
8 8 22 Sam LOWES GBR Speed Up Racing Speed Up 136.0 +27.024
9 7 23 Marcel SCHROTTER GER Tech 3 Tech 3 136.0 +27.485
10 6 4 Randy KRUMMENACHER SWI JIR Racing Team Kalex 136.0 +28.062
11 5 40 Alex RINS SPA Paginas Amarillas HP 40 Kalex 135.8 +30.768
12 4 7 Lorenzo BALDASSARRI ITA Forward Racing Kalex 135.6 +32.685
13 3 71 Tomoyoshi KOYAMA JPN NTS T.Pro Project NTS 135.6 +33.995
14 2 72 Yuki TAKAHASHI JPN Moriwaki Racing Moriwaki 135.4 +36.582
15 1 36 Mika KALLIO FIN QMMF Racing Team Speed Up 134.9 +43.672
16 60 Julian SIMON SPA QMMF Racing Team Speed Up 134.5 +48.256
17 2 Jesko RAFFIN SWI sports-millions-EMWE-SAG Kalex 134.5 +49.421
18 73 Alex MARQUEZ SPA EG 0,0 Marc VDS Kalex 134.3 +51.712
19 57 Edgar PONS SPA Italtrans Racing Team Kalex 132.3 +1'20.982
20 96 Louis ROSSI FRA Tasca Racing Scuderia Moto2 Tech 3 131.6 +1'31.219
21 66 Florian ALT GER E-Motion IodaRacing Team Suter 131.3 +1'36.116
22 30 Takaaki NAKAGAMI JPN IDEMITSU Honda Team Asia Kalex 131.0 +1'41.127
23 70 Robin MULHAUSER SWI Technomag Racing Interwetten Kalex 112.8 2 Laps
Non classificato
39 Luis SALOM SPA Paginas Amarillas HP 40 Kalex 135.6 6 Laps
10 Thitipong WAROKORN THA APH PTT The Pizza SAG Kalex 134.1 7 Laps
12 Thomas LUTHI SWI Derendinger Racing Interwetten Kalex 131.2 8 Laps
19 Xavier SIMEON BEL Federal Oil Gresini Moto2 Kalex 134.3 10 Laps
97 Xavi VIERGE SPA Tech 3 Tech 3 133.6 11 Laps
49 Axel PONS SPA AGR Team Kalex 122.5 11 Laps
16 Joshua HOOK AUS Technomag Racing Interwetten Kalex 132.3 12 Laps