Dopo una lotta serratissima che si è conclusa all'ultimo secondo disponibile, il poleman di Misano è Brad Binder. Il sudafricano ha strappato la prima casella ad Enea Bastianini e a Nicolò Bulega. Decimo Di Giannantonio, mentre solo 13esimo e 14esimo Locatelli ed Antonelli.

Il favorito numero uno per il campionato del mondo ha fermato il cronometro 1'42.398, staccando di un decimo e mezzo Enea Bastiani e di due decimi e mezzo Nicolò Bulega. Il pilota del Team Gresini, si è dovuto arrendere allo strapotere della Ktm di Binder dopo aver dominato il venerdì. Per il pilota dello Sky Racing Team invece è la terza prima fila in carriera e domani avrà la possibilità di agguantare la prima vittoria in carriera nel gran premio di casa. Ad aprire la seconda fila c'è la sopresa Kornfeil che precede il sempre ottimo Navarro, messo fuori causa da una caduta alla Rio a pochi attimi dalla bandiera a scacchi, e Canet. Settima posizione per Oettl, seguito da Ono e Guevara, in decima posizione troviamo Fabio Di Giannantonio, nuovo pilota del Team Gresini per il 2017, che precede Gabriel Rodrigo ed il futuro compagno di box Jorge Marti, anche lui caduto alla Rio.

Male gli altri italiani: 13° Locatelli, seguito da Antonelli. I due accusano oltre sette decimi di ritardo da Binder e difficilmente potranno lottare per la vittoria o il podio domattina. Diciassettesimo il neo acquisto dello Sky Racing Team VR46, Lorenzo Dalla Porta, protagonista di una scivolata alla Misano, , poi 20° Manzi, 22° Migno e sorprendentemente 25° Pecco Bagnaia che è apparso molto in difficoltà in queste prove ufficiali.  

LA GRIGLIA COMPLETA:

 
1 41 Brad BINDER RSA Red Bull KTM Ajo KTM  1'42.398
2 33 Enea BASTIANINI ITA Gresini Racing Moto3 Honda +0.150
3 8 Nicolo BULEGA ITA SKY Racing Team VR46 KTM +0.233
4 84 Jakub KORNFEIL CZE Drive M7 SIC Racing Team Honda +0.261
5 9 Jorge NAVARRO SPA Estrella Galicia 0,0 Honda +0.312
6 44 Aron CANET SPA Estrella Galicia 0,0 Honda +0.444 
7 65 Philipp OETTL GER Schedl GP Racing KTM +0.557 
8 76 Hiroki ONO JPN Honda Team Asia Honda +0.564
9 58 Juanfran GUEVARA SPA RBA Racing Team KTM +0.587
10 4 Fabio DI GIANNANTONIO ITA Gresini Racing Moto3 Honda +0.635 
11 19 Gabriel RODRIGO ARG RBA Racing Team KTM +0.682 
12 88 Jorge MARTIN SPA Gaviota Mahindra ASPAR Mahindra +0.714
13 55 Andrea LOCATELLI ITA Leopard Racing KTM +0.722
14 23 Niccolò ANTONELLI ITA Ongetta-Rivacold Honda +0.735
15 95 Jules DANILO FRA Ongetta-Rivacold Honda +0.824 
16 36 Joan MIR SPA Leopard Racing KTM +0.893
17 48 Lorenzo DALLA PORTA ITA SKY Racing Team VR46 KTM +0.947 
18 11 Livio LOI BEL RW Racing GP BV Honda +0.950 
19 20 Fabio QUARTARARO FRA Leopard Racing KTM +1.092 
20 62 Stefano MANZI ITA Mahindra Racing Mahindra +1.286 
21 64 Bo BENDSNEYDER NED Red Bull KTM Ajo KTM 203.1 1'43.761 1.363 / 0.077
22 16 Andrea MIGNO ITA SKY Racing Team VR46 KTM +1.370
23 6 Maria HERRERA SPA MH6 Team KTM +1.395
24 7 Adam NORRODIN MAL Drive M7 SIC Racing Team Honda +1.583 
25 21 Francesco BAGNAIA ITA Gaviota Mahindra ASPAR Mahindra +1.593
26 12 Albert ARENAS SPA Peugeot MC Saxoprint Peugeot +1.622
27 89 Khairul Idham PAWI MAL Honda Team Asia Honda +1.807 
28 42 Marcos RAMIREZ SPA Platinum Bay Real Estate Mahindra +1.813
29 17 John MCPHEE GBR Peugeot MC Saxoprint Peugeot 2+1.894 
30 24 Tatsuki SUZUKI JPN CIP-Unicom Starker Mahindra +1.916 
31 43 Stefano VALTULINI ITA 3570 Team Italia Mahindra +2.315
32 77 Lorenzo PETRARCA ITA 3570 Team Italia Mahindra +2.342 
33 40 Darryn BINDER RSA Platinum Bay Real Estate Mahindra +2.503 
34 3 Fabio SPIRANELLI ITA CIP-Unicom Starker Mahindra +3.289 / 
35 71 Alex FABBRI RSM Minimoto Portomaggiore Mahindra +3.735