Alfredo Santaelena Aguado comienza su andadura futbolística en el año 1987 en el Pegaso Tres Cantos, que militaba en Tercera División. Al año siguiente ascendería de categoría al jugar con el Getafe, la cual pertenecía a la Segunda División B. En esta época también sería convocado para jugar con la selección española sub21.

En 1987, Santaelena ficha por el Atlético de Madrid y se convierte en jugador de la máxima categoría del fútbol español. Este sería el equipo que le haría consolidarse como jugador al ser una pieza clave en el conjunto y disputar la gran mayoría de los partidos como titular. En él gana la Copa del Rey en 1991, su primer título. Lo consiguió siendo el artífice del único gol del encuentro frente al RCD Mallorca, por lo que su actuación fue vital para la victoria. Al año siguiente, Alfredo vuelve a ganar la Copa del Rey con el equipo colchonero frente al Real Madrid en el Santiago Bernabéu, el estadio blanco.

Fichaje por el Deportivo

El centrocampista llega junto a su compañero Donato a A Coruña en 1993. El madrileño, en su estancia en tierras gallegas, ganó dos títulos con el conjunto deportivista durante los cuatro años que fue defensor de la camiseta blanquiazul. El primero de ellos fue la Copa del Rey de 1995. La final se inició el 24 de junio, pero debido a las condiciones meteorológicas hubo que suspender el partido que tenía un resultado de empate a uno frente al Valencia. El 27 de junio sería el día en que se reanudarían los diez minutos que faltaban por disputarse. Cuando todavía no se había cumplido ni un minuto del inicio, Alfredo aprovecha una falta de entendimiento entre los ches Zubizarreta y Juan Carlos y marca un gol de cabeza para poner el uno a dos a favor de los herculinos. Santaelena vuelve a dar un título a su equipo gracias a un gol decisivo, como ya hiciera con el Atlético de Madrid también frente al Real Madrid en su estadio.

El segundo título ganado por el centrocampista fue la Supercopa del mismo año, la de 1995. La ganó nuevamente frente al equipo merengue al conseguir el conjunto blanquiazul un cómputo global de cinco a uno. Además de sus títulos con el conjunto blanquiazul, Santaelena jugó 128 partidos con el Deportivo entre Liga, Copa del Rey, Supercopa y UEFA y marcó un total de cinco goles, entre los que destaca el que dio la victoria de la Copa del Rey al club herculino.

Sevillista, azulón y vuelta a los inicios

A mitad de la temporada 1997/1998, Santaelena es traspasado al Sevilla FC, donde jugó tres años. En el momento en el que llegó a la ciudad andaluza, el equipo militaba en Segunda División, en la que jugó hasta conseguir el ascenso a Primera División con el club hispalense en la siguiente temporada. El año siguiente, el Sevilla vuelve a descender a la división de plata, pero Alfredo es fichado por el Getafe, también en Segunda. Con el club azulón vuelve a sufrir un nuevo descenso, esta vez a Segunda División B. Finalmente, vuelve al Pegaso Tres Cantos en su último año como futbolista profesional antes de anunciar su retirada en el año 2002 con 34 años de edad.

Actual etapa como entrenador

El exjugador profesional comienza su andadura como entrenador también en el Pegaso Tres Cantos, donde inicia y finaliza su carrera como futbolista. Allí pasó tres años en los que consiguió llegar a fase de ascenso a Segunda División B, que finalmente no fue materializada.

Posteriormente, Santaelena ficha por el Cobeña de Tercera División y consigue el ascenso a Segunda División B frente al filial del Deportivo de la Coruña. Al año siguiente, no es capaz de evitar que el Cobeña descienda de categoría y vuelva al lugar de donde lo cogió. A partir de aquí comienza una etapa de vaivenes por los clubs de fútbol como entrenador donde pasa una temporada en cada equipo: CD Ciempozuelos (Tercera División), Unión Deportiva Ibiza Eivissa (Segunda División B), UD Marbella, Fútbol Alcobendas Sport (Tercera División) y Atlético de Madrid C (Tercera División, Grupo 7).

Actualmente y desde noviembre de 2014 es el segundo entrenador del Cádiz CF, dentro del equipo técnico del entrenador Claudio Barragán. Recientemente Santaelena ha conseguido con el equipo el ascenso a Segunda División, en la que militará el equipo la próxima temporada. 

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