El primer título de Macnelly Torres Berrío llegó en el Torneo Finalización de 2004, con el Junior de Barranquilla. Nació en esa ciudad el 1 de noviembre de 1984 y jugó de mediapunta, con el 10 a la espalda en casi todos sus clubes. En casi dos décadas como profesional pasó por el fútbol colombiano, el chileno, el mexicano, el saudí y el paraguayo. Su etapa más larga fue en el Atlético Nacional, donde lo apodaron «el Mago».
Se formó en las categorías inferiores del Junior y debutó en el primer equipo a comienzos de la década de 2000. En 2003 fue convocado con la selección colombiana sub-20 para el Mundial de la categoría en los Emiratos Árabes Unidos. Disputó cinco partidos y Colombia terminó tercera. Al año siguiente formó parte del Junior que ganó el Finalización 2004. En 2005 se marchó al Cúcuta Deportivo.
Cúcuta y el salto a Chile
En Cúcuta ganó su segunda liga colombiana, el Finalización 2006, el primer título de liga en la historia del club. A mediados de 2008 fichó por el Colo-Colo, su primera salida al extranjero. En Santiago tuvo un papel más ofensivo y más participación en la creación de juego. Ganó los torneos de Clausura de 2008 y 2009 en la Primera División de Chile.
Atlético Nacional, primera etapa
En enero de 2011 volvió a Colombia para jugar cedido en el Atlético Nacional y ganó el Torneo Apertura de ese año. Pasó la segunda mitad de 2011 en el San Luis del fútbol mexicano y en 2012 regresó a Medellín. Ese año Nacional ganó la Superliga y la Copa Colombia. En el primer semestre de 2013 llegó el Apertura, decidido en la final contra Independiente Santa Fe: Torres fue titular en la ida, que acabó 0-0 en el Atanasio Girardot, y también en la vuelta. Fue la duodécima liga de Nacional. En julio de 2013 confirmó su salida al Al-Shabab de Arabia Saudí. Carlos Valderrama criticó públicamente esa decisión.
Arabia Saudí y vuelta a casa
Con el Al-Shabab ganó la Copa del Rey de Campeones de 2014. A comienzos de 2015 volvió al Junior, aunque tuvo que esperar el aval de la FIFA para poder jugar. En junio de ese año fue presentado de nuevo en el Atlético Nacional, donde estuvo tres temporadas más. En diciembre de 2015 ganó el Finalización y en 2016 la Copa Colombia.
La Libertadores de 2016
En 2016 Nacional ganó la Copa Libertadores, su segunda, tras vencer en la final a Independiente del Valle por 2-1 en el global, con la vuelta en Medellín. Torres fue uno de los fijos del equipo de Reinaldo Rueda, y a final de año entró en el Equipo Ideal de América de la encuesta del diario uruguayo El País, en un once con siete jugadores de Nacional. En 2017 llegaron la Recopa Sudamericana y el Torneo Apertura. En julio de 2018 se despidió del club y fichó por el Deportivo Cali.
Selección Colombia
Debutó con la selección absoluta el 17 de junio de 2005, en un amistoso contra Guatemala. Ese verano jugó la Copa de Oro de la Concacaf, en la que Colombia llegó a semifinales, y en 2007 disputó los tres partidos de la Copa América de Venezuela. Jugó las eliminatorias de Sudáfrica 2010, Brasil 2014 y Rusia 2018. Sumó 48 partidos y 4 goles entre 2005 y 2017: a Haití y a Bolivia en 2009, otra vez a Bolivia en el 5-0 de Barranquilla de marzo de 2013 y a Venezuela en septiembre de 2016.
Últimos años y retirada
En el Deportivo Cali estuvo solo la segunda mitad de 2018. En enero de 2019 fichó por el Libertad de Paraguay y ese año ganó la Copa Paraguay. En febrero de 2020 volvió a Colombia para jugar en Alianza Petrolera, y su último partido oficial fue el 8 de noviembre de 2020, en el estadio Romelio Martínez. Tras un año sin equipo, anunció su retirada en diciembre de 2021. La prensa colombiana le contó 16 títulos.
