Revelado pelo Corinthians em 2012 pelo técnico Tite, hoje seu treinador na Seleção Brasileira, tudo na carreira de Marquinhos aconteceu muito precoce. No mesmo ano, conquistou o titulo da Copa São Paulo de Futebol Junior sendo um dos principais destaques daquela edição. Foi promovido aos profissionais e fez apenas 14 jogos pelo Timão.
No final daquela temporada, foi vendido para a Roma onde começou a se destacar. O sucesso foi rápido, tanto que abriu os olhos dos milionário franceses do Paris Saint-Germain. Em 2013, se transferiu para a França e ficou na reserva de David Luiz até sua volta ao Chelsea.
Na Seleção principal, estrou contra Honduras, em 2013, aos 18 anos. Após o vexame do Brasil em 2014, perdendo de 7 a 1 para a Alemanha, e com a perde de espaço de David Luiz e Thiago Silva, Marquinhos começou a ganhar titularidade ao lado de Miranda. Sua grande primeira conquista com a Amarelinha foi nas Olimpíadas de 2016 no Rio de Janeiro, quando conquistou o inédito ouro olímpico, estreando na Arena Corinthians, primeira vez no estádio do time que o revelou.
Agora, pela Seleção principal, Marquinhos volta à Arena Corinthians pela segunda vez. Para o jogador, tem um gosto especial, mesmo que não tenha jogado no estádio como profissional do Corinthians, o local era onde a base do time jogava.
"Aqui é minha casa, era o CT da base do Corinthians. Foi aqui onde morei por cinco anos da minha vida. Subia de metrô na estação Itaquera e vinha treinar. Fui formado como homem, jogador, atleta e devo muito ao Corinthians. Voltei ao estádio na Olimpíada e tive boas recordações. Espero ter outro final feliz agora", comentou Marquinhos.
O zagueiro deverá ser titular na próxima terça-feira (28), quando o Brasil enfrenta o Paraguai pelas Eliminatórias da Copa, às 21h45.